瑜伽宗分别修行由凡夫至成佛的阶段为五位或六种住。六种住是：一、种性住，即是修行的开始，种性喻如人的家族姓氏，不可更改。种性便是生在佛家不可改转，所谓入住位。二、解行住，是依解起行，即是十住、十行、十回向位，总称为三贤位。三、净心住，就是十回向满，进入初地，最初明见真如理，破除一切见惑。四、行道迹住，是自初地至七地，以有功用心修习真观，渐次断思惑，有行道证入之迹。五、决定住，就是自第八地至第十地，无功用道，任运增进，决定不退。六、究竟住，就是等觉地和佛地。
    六种住之中，后五位的建立与中观宗相同，只是对最初种性住有所争论。中观宗主张一乘就是一切众生皆有佛性，都能成佛。瑜伽宗既主张一切由种子生现行，生死是有漏种子所生的现行，道业是无漏种子所生的现行。无漏种子有两种：一是本性住种，是无始以来依附于阿赖耶识，法尔所得的无漏种子，这是一切有情都具有的。二是习所成种，是由闻、思、修熏习所成的无漏种子，这不是每一有情所同具的。这习所成种有五种不同：一声闻种性、二缘觉种性、三佛种性、四不定种性、五无种性。具声闻种性和缘觉种性的有情是定性二乘，只能得小乘涅槃，唯有佛种性的有情和不定种性的有情(回小向大)可以成佛。无种性的有情只能轮回六趣，决定无有道证。种性住便是具有习所成的佛种性，决定可以发菩提心，行菩提道。
    五位是资粮位、加行位、见道位、修道位、究竟位。资粮位相当于第二解行住，见道位相当于第三净心住，修道位相当于笫四行道迹住和第五决定住，究竟位相当于第六究竟住。五位所特殊是增加了加行位。以出门旅行为譬，资粮位如准备出行所须的资财糗粮。加行位如财粮已充足，捆扎行李。见道位如开始启程。修道位如上路前进。究竟位如到达目的地。以时间而论，资粮位须时一阿僧祇劫；修道位中初地至七地为一阿僧祇劫，八地至十地为一阿僧祇劫；见道位仅一刹那心；加行位一生多生不定。
    资粮位是但能信解唯识的道理，而不能证得能取、所取皆空。以有所得修行六度、四摄、四无量心等以自利利他，用来培植累积自己的福德和智慧，并磨练自己的勇猛心情，进修不退。当福智培植到一定程度，便必须进修加行，方能见道，体会能取、所取皆空。见道以后，才能如实修行。
    加行位有四个阶段，所谓暖、顶、忍、世第一。加行位是正修唯识观。观察一切事物的名、义、自性(个体)、差别(属性)都是假有而无实。名是语言文字，义是依名所表达的意义；自性是事物的自体，差别是事物的属性。这能诠的名字既是假立的，名所表示的义意也不会真实。根据能诠的名和所诠的义去推求事物的自体和差别，也不可得。只不过是用假立的名言为因，经过忆念，生起领解而已。初观此名、义、自性、差别的法都是自心变现，假施设有，实不可得，便证所取空。进而观察能取之识也空，因为所取的境与能取的识是相待而有，离了能取的识，无有真实的境；离了所取的境，也无有真实的识。当开始观察名、义、自性、差别，唯是自心变现而无实，是暖位。进而观察成熟，决定认可，便是顶位。这二位中是依能取识观所取空。进而观能取识也空而无实，知能取空是忍位。进而观能取、所取皆空，唯存有空相，便是世第一位。
    能舍离空相，以无所得智顿断分别所起烦恼障(人我见)和分别所起的所知障(法我见)，证得人空与法空所显的真如理，这便是见道位。
    依见道位如实所见的真理，数数修习，逐步断除修所断的烦恼障，这便是修道位中十地的进修。
    最后到究竟位，断除修所断的所知障和一切习气，证得佛果，尽未来际化度有情。