唯识观是瑜伽宗修养的根本方法。唯识观所依据的就是三自性，方法便是四加行。就观的浅深而分别有五重次第：第一，遣虚存实；第二，舍滥留纯；第三，摄末归本；第四，隐劣显胜；第五，遣相证性。第一遣虚存实是遣除遍计所执性之虚妄而存依他起性之真实；第二、三、四观是观依他起性的因缘；第五遣相证性是遣依他起性的假有而证圆成实性的真实。第一观是观所取空，第二、三、四观是观能取空，第五观是双观二空。
    第一，遣虚存实。遣虚是以空观观遍计所执性而破有见，存实是以有观观依他起性而破空见，借此而得证人离言法性。有、空二见若破，空、有二观亦不成立，并非有决定的空和决定的有。因为真观非有非空，诸法不可分别思议。只是观遍计所执的人我、法我是虚妄，体会人空、法空，方能证入真性。然而真性不是空。观祛应当是贯串于四加行，四寻思、四如实智都包括其中。
    第二，舍滥留纯，是舍境留心之义。一切识有四分，所谓相分、见分、自证分、证自证分。内识相分如外境现，是所缘的境；见分、自证分、证自证分是能缘的心。外境是疏所缘缘，相分是亲所缘缘，都舍而不取，唯观能缘之心。这就是《华严经》所说“三界唯心”的观法，也就是《遗教经》所说“制心一处，无事不办”的要义。
    第三，摄末归本，是摄用归体之义。相分是识内所取的境界，见分是识内能取的作用，深观此二都是从识的自体而起。识的自证分是本，见、相二分是末。所以说是唯识所现。
    第四，隐劣显胜。八识自体各有心王和心所有法，八识如王，所以称胜；心所有法如臣，所以是劣。观一切心所作业，都是识自体所变现，所以说，一切染净，只是随心而观。
    第五，遣相证性。相是事相，性是理性。八识各自证分是依他起性的事相。但是事相的本质却是二空所显的圆成实性。观察依他起的事相是空虚，如是除遣，便证得圆成实性的真实。所谓第一义谛、佛性、法身、如来藏、真如、不二法门等，都包括在此观之内。
    如是五重，空有为第一重，境心为第二重，用体为第三重，所王为第四重，事理为第五重，逐步从粗至细，由浅及深，便证唯识道理总摄一切教法。欲界修习此观只有闻慧和思慧，色界修习便具足闻思修三慧，无色界修习此观只有修慧。也可知真正修观，只有依定而修的。