陕甘宁边区医院成立于1937年10月，由军委卫生部领导，傅连暲任首任院长。医院分设住院部(在宝塔山南麓)、门诊部(在延安城内)。1938年11月，日本飞机轰炸延安后，门诊部迁至延安城东二十里铺(今属延安市桥沟乡)。同年底，边区医院交边区政府民政厅领导，欧阳竞任院长。
    1938年底，陕甘宁边区医院开始在安塞县黄瓜塌(今属真武洞镇)新建院址。1939年5月13日，边区政府民政厅根据边区第一届参议会决议，决定扩大并改进边区医院。同年6月15日，边区医院由延安迁至安塞黄瓜塌新址。新址共打土窑洞65孔，建房屋40间。7月15日，边区医院开始收治病员。医院门诊部设在真武洞以南的白家坪。这一时期，医院没有内科、外科、妇产科、儿科和化验室、X光线室、显微镜室等。医院有病床100余张，有医护人员和其它职工共计100余人。
    1942年秋，边区医院迁回延安，驻城南白家坪，安塞则改设边区医院分院。1946年3月，边区医院迁驻桥儿沟“鲁艺”旧址。这时，医院有病床150余张。
    边区医院主要为边区一级党政机关服务，同时也为驻地群众服务。据统计，1941年群众病员占就诊人数的25％；1942年为27％；1943年为30％。
    1942年9月25日，以边区医院为主筹办的边区医药学校正式开学。边区政府副主席李鼎铭题词：“济世活人之学”。医校校长李治。医校以边区医院为临床实习医院。
    1946年6月1日，边区医院和有关单位筹办的西北医药专门学校在桥儿沟正式开学。医院院长马荔兼任副校长。
    1947年3月，边区医院改为战时编制，撤离延安，随军转战。1948年5月，迁回延安，驻城南花石崖砭西北局旧址。1949年6月，医院大部分人员随边区政府机关进驻西安。其余人员则于1950年3月，在花石崖砭组建成立了延安地区人民医院，一直沿续至今。
    陕甘宁边区医院在安塞黄瓜塌，延安宝塔山麓、白家坪等地旧址，仅保留部分土窑洞。在桥儿沟的旧址，即“鲁艺”院址。