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　　草堂寺位于秦陵与秦兵马俑之间的焦村。当地人说，该寺院原名叫“杏花院”。秦始皇死后，灵柩从沙丘运回后停放在杏花院“停草”，因而改名草堂寺。
　　“停草”和“坐草”均是关中一带祭奠亡灵活动的简称。据说，这些风俗就是从秦时流传下来的。孝子在灵前，都是双膝着地，地上要铺麦草，跪着哭孝，很像古人的跽坐，所以叫坐草。
　　传说坐草之时，杏花院发生了一桩骇人听闻的血案。
　　秦始皇有几十个儿女，二世胡亥是第十八位公子。继承皇位的应该是太子扶苏。秦二世的皇位是用于赵高的阴谋夺来的。他害死扶苏，杀了边关大将蒙恬。皇宫内外人心不服，却也敢怒不敢言。二世和赵高自己也感到根基不稳。
　　始皇的灵柩进入杏花院之后，灵堂里发生了许多怪事。先是供桌上蜡烛的火苗不稳，忽而升起，忽而落地，像火球似的满地滚动。到了子夜，灵柩棺木又“嗦嗦”作响。哭灵的众公子、公主们个个毛骨悚然。守灵官不敢怠慢，急忙将此事禀报二世。二世命方士占卜，卦象大凶。方士禀告说：“始皇灵魂发怒，将于陛下不利。”
　　二世吓得没了主意，急忙与赵高商议，心怀鬼胎的赵高先是一惊，转念又想：“活人何惧死人?何不借此机会……”，他面带奸笑，上前与二世耳语：“斩草除根，以绝后患。”二世微笑点头，即命草书圣旨：众公子不敬不孝，心怀不轨，灵堂有异，是父王天灵发怒，降罪下来，诸人命当处死。
　　欲之加罪，何患无辞。公子们面面相觑，束手无策，只能任二世宰割。有一公子心一横，反正是死，不如骂个痛快，死也不屈。开口大骂：“竖子胡亥，害死父王，逼死太子，谋取皇位，今又加害我等，可叹秦国帝业将毁于竖子之手！”他不待武士上来，便拔剑自刎。 
　　二世被骂得狗血淋头，不知所措。赵高在一旁大声喊道：“还不动手！”武士们刀、枪、剑、戟一齐杀将上来。一阵刀光剑影之后，惨叫之声渐渐平息。兄弟姐妹差不多被杀尽了，这才解除二世心头的大患。可他又想，刚才一番臭骂，揭穿了自己的老底，万一传了出去，岂不坏了大事。赵高向二世密语：一个也不要放过。于是传下话来，说圣上诛杀了谋反之辈，要庆贺一番，现在要请在场的每个人进地宫看戏，饮酒，并给予重赏。上至王公大臣，下至平民百姓，全部被骗入秦陵地宫。除一人幸免，其余均被坑杀。
　　据说，幸免于难的是秦始皇的一个外孙。他入地宫后，发现北排水道水流不大，便钻了进去，爬了几天几夜，从鱼池湖底浮出。他死后，葬于新丰，当地人所谓的“大冢”，传说就是他的陵墓。
　　在民间传说中，草堂寺还是秦始皇陵园的东界。在明清时，寺院有三间正殴，里面还供奉着秦始皇的塑像。解放前，每年农历9月，草堂寺有五天庙会。传说这是始皇下葬的时间，村民们来草堂寺祭奠那些死于非命的无辜亡灵。解放后，草堂寺开办了一所小学。据在此上过学的人回忆，当时庙里有三通石碑。碑文多是明清时期“重修草堂寺记”之类。“文革”期间，村民拆了庙宇。如今，草堂寺仅存几堵残垣败壁。
　　1976年10月，秦始皇陵兵马俑考古队在焦村草堂寺西360米处，发现17座墓葬。对其中8座进行了发掘。其中一座的棺椁内仅出一柄青铜短剑而未见人骨，其余7座墓内各有人骨架一具。女性2人，男性5人，年龄均在20—30岁之间。七具尸骨中有六具身、首、四肢分离，有一男性头骨上插铜簇一支，其中有一20岁左右女性两臂伸张，被肢解成六块。根据种种迹象推测，他们有可能是秦始皇的公子和公主。